中国官方央视报导，中共纪委系统中，很多轰动全国的省部级高官腐败案，祁培文都曾直接参与，是成克杰案、胡长清案和广东湛江海关走私大案等案件的负责人。
他在谈到巡视组的人身安全问题时说，一次在一个省巡视，有人给他写信：“一句话，这个地方没有你做的事儿，玩一玩回去吧。你要是不回去，没有好下场”。
他称，中纪委办案的难度在于办案对象都是高级干部，位高权重，有的还在领导岗位上。对这样的领导干部作调查就很困难，因没有什么特殊手段，也不像检察和公安机关，若犯罪就可以抓他，中纪委不能这样，只能靠谈话。
他并提到，“双规”（在规定时间、地点交待问题）腐败官员，不是巡视组的职权，巡视组没有这个权力。巡视不代替查案，“双规”是中共党内的一种制度，要经过批准，要严格控制。
另据《新京报》，近年来腐败官员和利益集团干扰、阻碍纪委办案的情况并不少见，主要有恐吓、威胁和通风报信等多种不配合的方式。
