民主行动党自从1999年与安华的国民公正党（2003年后易名为人民公正党）结盟以来，它就面对跌宕起伏的政运，也在困境和挑战中求存和发展。因为这也是行动党第一次与伊斯兰党（当时称为回教党）直接公开结盟，不再像1990年东姑拉沙里的46精神党，一边与伊党合作组“伊教团结力量”（APU）；另一边又与行动党组“人民阵线”的“间接结盟”。
在当年林吉祥也同意反对党，即公正党、伊党、行动党及人民党结合起来，组成“替代阵线”。尽管安华已身陷囹圄（1998年9月20日起已被扣捕，直到2004年8月才获释放），但由其夫人旺阿兹莎领导的公正党也起了制衡作用，以平衡伊党和行动党之间不可协调的矛盾。
大意失荆州
正因为行动党想寻求突破，也就不在意在安华撮合下，与伊党平起平坐。讵料却“大意失荆州”。在1999年的大选中，林吉祥以及卡巴星两巨头双双落马，并失去掉国会议席，只剩下10名国会议员。风头甚健的伊党不但掌控吉兰丹和登嘉楼州政权，也首次拥有27名国会议员。反之安华的公正党只能拿下5席。这就是说，伊党是大赢家，也因为安华效应造就了伊党。
遗憾的是，脱颖而出的伊党即刻与巫统较量伊斯兰国路线图，它要马哈迪证明巫统的伊斯兰国大蓝图比伊党的好。
由于这样，行动党越发不能再与伊党合作下去，否则行动党将会被带去“荷兰”（完蛋）。在痛定思痛下，行动党在2001年（911事件之前）退出替代阵线，自行上路。
也因为不再与伊党合作，即便在2004年的大选，反对党“四分五裂”，行动党还勉强拿下12个国会议席；尤其重要的是，林吉祥和卡巴星这两尊大炮，又回到国会了。另一方面，因为伊党过于自信，因此只剩7名国会议员，而吉兰丹州政权也差些被国阵拿下（双方只有3席之差）。
虽然安华已在2004年大选（国阵大胜）后的半年出狱，但他还得审时度势未敢再促请行动党归队；行动党则是“一朝被蛇咬，十年怕井绳”，再也不相信可以破镜重圆。
反对党议席飙升
安华在没有更好的方案下，只能采用东姑拉沙里1990年大选的战略，分别与伊党和行动党合作，主要是不出现三角战。虽没有共同政纲，也没有竞选宣言，但2008年的大选在反风猛吹下，市面上有各种各样的传言。结果反对党在一夜之间拿下五个州的执政权（吉兰丹、吉打、槟城、霹雳及雪兰莪），国会议席更飙升至82席（国阵拥有140席，继续执政中央）。
在这样的意外丰收下，安华马上将三党组织起来，称为“人民联盟”（民联），以和国阵分庭抗礼。
成为民联共主的安华意气风发，也在同年8月参加峇东埔补选而胜出，被推举成为反对党领袖。然而好景不长，行动党在2012年12月的中委改选成绩不被社团注册官接受，因为有投诉说出席者与代表名单不符，因而要求行动党重选，否则派出的候选人参加大选有问题。
在举棋难定下，行动党与伊党和公正党商议，后两者允准行动党使用他们的标志参加大选，其中行动党候选人在西马用伊党标志参选；至于东马，行动党则使用公正党的标志参选。
在一切就绪后，人们都以为2013年的大选会出现新气象，但在未提名前，社团注册局又同意行动党候选人用回火箭标志上阵。为此行动党也在505大选取得更好的成绩。
让我们回想一下，如果2013年的大选时，行动党在西马属伊党候选人；而在东马又属公正党候选人，其结局又会怎样？没有人知道。
如果说大选的结果与308的成绩一样，则行动党议员要怎样标明自己的身份？
此外，再往深一层想，如果行动党的身份与伊党不清不楚，那么在2015年伊党与行动党绝交的事会发生吗？若会发生，结局又是怎样？若不会发生，行动党能同意伊党的伊教路线吗？以此推想再深想，反对党阵营可能乱成一团而又再一次分裂。
不接受重选成绩
行动党也不放松警惕，在大选后的同一年的9月29日进行重选，并将重选成绩呈交注册官。可是意想不到的是，注册官仍不接受重选成绩，认为出席党员与代表人数不符。此次是以文告方式公告，但行动党主席陈国伟说，没有收到公函不算数；而内政部副部长诺嘉兹兰则说，不需要行动党告知注册官如何做（发文告即等于通知对方），而且在三年前已告知不接受2013年的重选成绩。
这样一来，为安全起见，行动党又在2017年11月12日在吉隆坡举行重选，所产生的领导层基本与原来的大同小异，但是否会被注册官接受？也只有稍迟才知结果，只是行动党的党选竟要经过3次折磨，也可谓是让人大开眼界。这在政党史上，应该不曾有过的纪录。
现在距离第十四届大选已不远了，行动党只能祈祷不再有事了！
