打从巫统于1946年创党后，它就间断性地发生领袖失和的斗争，而后又重新合作，化干戈为玉帛。除开巫统创党人拿督翁（1951年）自行离开巫统另立新党（其儿子胡先翁也跟著离开）及东姑阿都拉曼（1963年）对付农业部长阿都亚兹，并开除党籍外，下来的巫统内部斗争总与一个人息息相关，这个人就是马哈迪。
马哈迪是一位传奇人物，他在1946年就加入巫统，但不活跃，直到1964年首次参加大选而成为国会议员。但在1969年的大选马哈迪痛失国席。三天后又爆发“513”种族冲突流血事件。不久马哈迪一马当先向东姑开炮，要他辞职下台，因为他领导的大选使联盟政绩大倒退。
马哈迪也因此成了争议性人物。首先他被东姑开除党籍（1969年）。接著敦拉萨取代东姑成为首相（1970年）。翌年（1971年）为感恩马哈迪的支持，敦拉萨在这一年将马哈迪召回巫统，恢复其党籍。就这样马哈迪在下来的年代成为巫统政治斗争的主角。
就在马哈迪回巢后，敦拉萨于1972年将拿督翁的遗像请回巫统，而承认他的创党地位（马华公会总部在1959年后就没挂林苍祐的肖像，直到2005年才被黄家定安放回去），这对胡先翁是最大的欣慰，也不计较拿督翁曾对党的“伤害”。
巫统的转变
1973年，伊斯迈病逝，敦拉萨提拔胡先翁出任副揆（他们两人是同门襟兄弟）。换句话说，胡先翁是第一个退出（不是被开除）巫统而回来后竟跃升为党政的第二号人物。
1974年的大选，马哈迪重回国会，他被委为教育部长，开始他的新政治长征。1975年，马哈迪再次角逐党副主席（共8人提名），结果脱颖而出。依序排名是嘉化峇峇、东姑拉沙里及马哈迪。1976年敦拉萨逝世，胡先翁升正，他本来有心要提拔内长加沙里沙菲益为副相，无奈后者只是巫统理事而非票选副主席。在压力下，胡先翁只好从三名副主席中挑一人成为副手。意料之外的是他选马哈迪（中委得票最低者），而不选嘉化与拉沙里。就这样嘉化不入阁，拉沙里保留财长职，心中也有不快。
当1981年，胡先翁退休，把棒子交给马哈迪接班时，一场好戏上演了。一方面他巧妙地认同慕沙希淡（在东姑眼中慕沙与马哈迪是站在一起的）与东姑拉沙里角逐署理主席，而胜者将成为副首相。就这样，在马哈迪操盘下，慕沙胜了，也堵住拉沙里更上一层楼。也是在这一年，马哈迪接纳了安华入党，从此巫统有了很大的转变。
1984年，不甘失败的东姑拉沙里又回来挑战慕沙希淡，结果还是不敌慕沙。在党选后慕沙要求马哈迪将东姑拉沙里排出内阁之外，马哈迪不同意；加上马哈迪也不满外界总是形容他的政府是“2M政府”（即取他和慕沙的名字第一个字母）。不久之后就传出慕沙与马哈迪失和的消息。
因为难于相处，慕沙在1986年辞卸副首相兼内政部长职，马哈迪在如释重负下委任嘉化峇峇出任副揆（他们两人曾因1976年竞争副首相而失和，在十年后，马哈迪圆了嘉化出任副相的梦。从失和到合作，这就是巫统政治的变数之一）。
可是最令马哈迪跌破眼镜的是慕沙希淡（仍保留署理主席）竟在1987年的党选时与他的宿敌东姑拉沙里联手，转过头来向当权派挑战。拉沙里的阵营来势汹汹，也有大将在其B队内（阿都拉及莱斯雅丁）。其结果是马哈迪的A队胜了。当年马哈迪的A队有安华、山努西及达因等助阵；后又得到纳吉的支持。
因为阵线分明，马哈迪在当选后的第一件事就是改组内阁，把B队的人马消除掉。吊诡的是：当东姑拉沙里在1989年组新党（46精神党）时，准备与巫统来个殊死战，却得不到慕沙的支持，也无法劝服阿都拉（他又跑回马哈迪阵营）。政局的变数本来就没有逻辑可言。
不妨再看看下列的例子：在1990年的大选，马哈迪取得决定性的胜利后，他就不再重视46精神党的势力（因为该党只胜了8个国席）。
宏愿队伍的挫折
当慕沙、拉加里及阿都拉势力消退的时刻，另一边的安华势力从中崛起了。他原本被视为与马哈迪组成最佳搭档，但当安华在1993年获选署理主席后（嘉化退选）引起马哈迪的不满，他对安华没有回旋的余地也有了其他想法。因此在1996年的党选，他出人意料地将多年的“政敌”东姑拉沙里及46精神党（46马来人党）拉回巫统，又将B队的阿都拉派上用场，以击破安华的“宏愿队伍”。
这里头的奥妙是阿都拉再当选副主席，取代慕尤丁。在不久之后，马哈迪为对付安华，也就不再计较阿都拉是B队的人，准备扶持他成为接班人。
虽然安华的“宏愿队伍”有受到某种程度的挫折，但势力仍保存；尤其是青年团及妇女组属于宏愿阵营。当时青年团团长阿末扎希也在后来脱离了“宏愿队伍”（离队的阿末扎希今天变成大红人，取代慕尤丁成为副首相）。事实上，马哈迪在1998年对付安华（解除官职及开除党籍）后，基本上与B队已一笑泯恩仇了，甚至在1999年大选时，马哈迪还让东姑拉沙里重掌吉兰丹联委会主席，以期从伊党手中夺回丹州政权。讵料事与愿违，拉沙里的首相梦也破灭了。
当马哈迪与安华斗争进入白热化之际，阿都拉已部署接位了。在2003年时，阿都拉从马哈迪手上接棒时，马哈迪是没有异议的，但他不忘催促阿都拉委纳吉成为副相，他这样做被认为是要“回报”纳吉父亲敦拉萨当年对他的提拔。
虽然马哈迪已卸职，但他的影响力仍在；尤其是在2008年大选后，国阵席位大减下，又促使马哈迪逼阿都拉下台，让位于纳吉。在当时慕尤丁也有加入劝解。
在形势比人强下，纳吉在2009年上位，也与慕尤丁结成同一阵线，领导国家和巫统（他们两人曾是宏愿队伍核心人物）。最近又因为一马发展公司（1MDB）事件闹得满城风雨，也导致慕尤丁与纳吉有不同的见解，终于有了内阁改组，慕尤丁被除名的大事（马哈迪也是促请纳吉下台的人）。
今天纳吉也因政见之争与慕尤丁关系闹翻，明天他们是否又粘在一起？我们不知道，毕竟巫统的政治是不断变化的，但万变不离其宗，只要这个党仍牢牢地抓住政权，领袖再怎么变都似乎不是大件事。
