投票周六下午4时结束，6个直辖市的点票结果显示，国民党在台北、台中、桃园、南部高雄和台南5个市的得票均败选，只有争取连任新北市长的朱立伦以微差票数打败民进党候选人、前行政院长游锡?。
无党派的台北市长候选人柯文哲以超过65万票胜选，国民党荣誉主席连战的儿子连胜文只有逾49万票。
此前，美国《纽约时报》报导指出，一名医生兼政坛素人被看好将在台北市长选举中获胜，这是台湾执政的国民党可能面临多年来最严重挫折的数项选举之一。
《纽时》指，55岁的医生柯文哲若是胜选，将是被国民党一向视为大本营的台北市的一大挫败，市长一职往往成为竞选台湾总统的跳板。过去3任总统都曾任台北市长，而且此次选举包括全国关注的议题，特别是台湾与中国的关系。
报导指出，目前是台湾总统马英九最后一届任期的一半，今年他的国民党寻求与中国关系更密切而遭到大规模抗议，加上一连串的食安丑闻，助长反政府的愤怒。
民众担心贫富差距
在台北市长竞选中，国民党的候选人是44岁的前投资银行家连胜文，虽然他凭借深厚人脉而赢得党提名，却无法拉抬对抗柯文哲的声势。
不属任何政党、但获民进党支持的柯文哲，把竞选主题放在鼓励公民参与，并试图超越国民党和支持拉近与中国关系者，及民进党和支持台湾独立者之间的鸿沟。但是他对政府事务没经验，使得很多人相信，他在民调的优势最终会被国民党组织严密的政党机器瓦解。
不过，缺乏政府经验的连胜文，虽然出身政治世家，却未能把握对手的弱点。他强调经济议题，凸显他的投资经验和曾担任管理台北捷运悠游卡系统的公司董事长。
但是中央研究院政治学家林继文表示，在民众愈来愈担心贫富差距之际，连胜文的家庭人脉和个人财富反而伤害他，“他太年轻，太没有经验，似乎不了解台北人民的生活疾苦”。
对马英九信任投票
这次九合一选举被认为是2016年台湾大选的前哨战，也是对兼任国民党主席的台湾总统马英九的“信任投票”。国民党败选，马将失去领导威信、党内必起逼宫声浪。
此前预计国民党最多可能丢掉1/3的县市，民进党则声称要拿下半个台湾。民进党在这次选举中大胜，党主席蔡英文就肯定会拿到参加2016年大选的入场券。
选情告急之下，马英九周五进行了行程近千公里、纵贯8个县市的选举前夜最后拉票活动，为代表国民党的台北市长候选人连胜文、台中市长候选人胡志强站台到最后一刻。
蔡英文也不甘人后，周五跑了6个县市，特别二进台中，出席最后一夜晚会，希望改变以往从中部往北都由国民党把持的政治版图。
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