(北京23日讯)中国新冠肺炎疫情究竟如何爆发,一直备受关注,有中国研究分析,湖北省武汉市华南海鲜市场的新冠病毒是从其他地方传入,并在市场快速传播。根据基因组重组时间推算,病毒可能在去年12月初,甚至11月下旬开始有人际传播。
此前已有研究人员分析,华南海鲜市场可能并非新型冠状病毒的发源地。另一边厢,早前到过北京、四川和广东的世界卫生组织(WHO)联合专家组,部分中外专家周六前往当地考察,预计调查病毒源头是他们的重点工作之一。
综合财新网、《中国科学报》报导,中国科学院西双版纳热带植物园、华南农大、中国脑科学研究所等机构的研究人员,在中国科学院科技论文预印发布平台ChinaXiv,发表题为《使用整个基因组数据解码新冠病毒的进化和传播》的预印文章。
研究人员收集截止2月12日,全世界共享到GISAID EpiFluTM数据库的病毒数据,包括四大洲12个国家的93个新冠病毒的基因组数据,其中54个来自中国,39个来自他国。
病毒或从其他地方输入
93个样本包含58种单倍型(基因类型)。单倍型演化关系显示,单倍型H13和H38则是比较“古老的”单倍型,通过一个中间载体与蝙蝠冠状病毒RaTG13关联,并通过单倍型H3衍生出单倍型H1。由于无第一例感染者样本和12月初早期感染者的样本,最初的古老/祖先单倍型或还没有被发现。
与华南海鲜市场有关联的患者样品单倍型,都是H1及其衍生的单倍型H2及H8-H12,而一份武汉样品单倍型H3与华南海鲜市场无关。可见,华南海鲜市场的新型冠状病毒是从其他地方传入进来,在市场中快速传播并蔓延到市场之外。
至于“古老的”单倍型H13和H38的病毒样品,深圳病患(广东首例)和美国华盛顿州的病患(美国首例),现有武汉样本中没有检测到H13和H38单倍型。
另外,新型冠状病毒在2月12日之前发生过两次明显的种群扩张,较早的发生在12月8日。这结果暗示病毒可能在12月初,甚至11月下旬已开始有人际传播。另一次种群扩张发生在1月6日,这或与元旦假期有关联。
值得注意,中国国家疾控中心1月6日发布二级应急响应。研究者称,当时预警起到一些警示作用,公众活动和出行都有所减少,若当时能引起大众更广泛重视,1月中下旬向全中国和全球蔓延的病例会有所降低。
对于其他地区的病毒来源,研究人员称中国其他9个省区和其他11个国家的感染病例,基本都是从武汉直接或间接输入。广东病毒或有两个来源,重庆和台湾的病毒有两个来源。
有较多样本的澳洲、法国、日本和美国,患者感染源至少有两个,美国包括5个来源。非常值得关注的是,H56这个超级传播者单倍型,它同时是澳洲、法国和美国,以及台湾患者的传染源。
此外,研究人员发现新型冠状病毒基因组没有发生重组事件。